Thời điểm lý tưởng nhất để du lịch Đảo Ngọc là từ khoảng tháng 11 đến tháng 4 năm sau. Đây là mùa khô ở phương Nam, trời ít mưa, biển lặng, sóng êm và nắng ấm thích hợp cho các hoạt động du lịch ngoài trời. Mùa này thích hợp cho những tour du lịch nghỉ dưỡng, không thích hợp cho khách đi bụi hoặc đi phượt.

Mùa khô được xem là thời gian lý tưởng để du lịch và tận hưởng những khoảnh khắc tuyệt vời nhất tại đảo ngọc.

• Mùa mưa: bắt đầu từ tháng 5 đến tháng 10, trong đó mưa nhiều nhất vào tháng 9, 10 và có thể kéo dài cả ngày. Thời gian này, các bãi bên bờ Tây đảo ngọc có thể xuất hiện sóng lớn, biển động, các bãi biển bờ Đông thường bị đục. Do đó, nếu lựa chọn du lịch Phú Quốc mùa mưa, hãy cân nhắc một số điểm đến tại Bắc đảo như Bãi Dài, hay Bãi Xếp, Bãi Đất đỏ… tại Nam đảo.